Tādā gadījumā, kad vispārējie spermas parametri – kustīgums, koncentrācija, morfoloģija – ir normas robežās, joprojām neveiksmīgu procedūru iznākumu cēlonis var būt sperma. Spermas DNS fragmentācija izpaužas kā DNS saites pārrāvums abās vai vienā DNS spirālē. Ja pārrāvums skar gēnus, kas nepieciešami embrija attīstībai un implantācijai, tad embrijs kādā posmā var iet bojā.
Dažos gadījumos spermas DNS fragmentāciju var samazināt, mainot dzīvesveidu, lietojot uzturā antioksidantus, kas iznīcina brīvos radikāļus, kā arī ārstējot slimības, kas var būt par cēloni DNS fragmentācijai.
DNS fragmentācijas tests var tikt veikts laboratorijas apstākļos. Tā pamatā ir spermas parauga apstrāde ar dažādiem reaģentiem un vizualizācija gaismas mikroskopā.